Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2A2P52657 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2A2P52657 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GTF2A2P52657 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A2P52657 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms