Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt2P50752 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms