Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms