Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTRNP46939 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTRNP46939 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTRNP46939 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTRNP46939 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
UTRNP46939 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UTRNP46939 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UTRNP46939 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms