Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mmp9P41245 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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