Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nckap1P28660 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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