Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2P0DI81 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms