Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA4O75676 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms