Protein–RNA interactions for Protein: O55192

Slc6a2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a2O55192 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a2O55192 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a2O55192 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms