Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms