Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms