Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx9Q9WUH2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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