Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms