Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHRF1Q9P1Y6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms