Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Caln1Q9JJG7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Caln1Q9JJG7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Caln1Q9JJG7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Caln1Q9JJG7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Caln1Q9JJG7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Caln1Q9JJG7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Caln1Q9JJG7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Caln1Q9JJG7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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