Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dap3Q9ER88 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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