Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cnot8Q9D8X5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms