Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Clca1Q9D7Z6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Clca1Q9D7Z6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Clca1Q9D7Z6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Clca1Q9D7Z6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Clca1Q9D7Z6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Clca1Q9D7Z6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Clca1Q9D7Z6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Clca1Q9D7Z6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Clca1Q9D7Z6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca1Q9D7Z6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms