Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4aQ9D6F9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb4aQ9D6F9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms