Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MINDY3Q9CV28 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MINDY3Q9CV28 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms