Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt23Q99PS0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt23Q99PS0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms