Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Pde6cQ91ZQ1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde6cQ91ZQ1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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