Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms