Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD1Q8NHV4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms