Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hpf1Q8CFE2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hpf1Q8CFE2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hpf1Q8CFE2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hpf1Q8CFE2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hpf1Q8CFE2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hpf1Q8CFE2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hpf1Q8CFE2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hpf1Q8CFE2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hpf1Q8CFE2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hpf1Q8CFE2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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