Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms