Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trappc6aQ78XR0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc6aQ78XR0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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