Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc88cQ6VGS5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms