Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casc4Q6P2L7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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