Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SypQ62277 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SypQ62277 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SypQ62277 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SypQ62277 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SypQ62277 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SypQ62277 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms