Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms