Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms