Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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