Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P58686 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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P58686 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P58686 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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P58686 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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P58686 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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P58686 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P58686 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P58686 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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P58686 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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