Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1swP51491 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms