Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd1P13516 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd1P13516 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd1P13516 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd1P13516 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd1P13516 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd1P13516 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd1P13516 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd1P13516 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd1P13516 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd1P13516 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms