Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShdO88834 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShdO88834 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShdO88834 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShdO88834 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShdO88834 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShdO88834 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShdO88834 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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