Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capns1O88456 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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