Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms