Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Kpna4O35343 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Kpna4O35343 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Kpna4O35343 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Kpna4O35343 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna4O35343 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms