Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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