Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms