Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atf6F6VAN0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf6F6VAN0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms