Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
1700042G07RikB1AUF7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms