Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r2A2AMT6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r2A2AMT6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms