Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms