Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme4Q9WV84 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms