Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms