Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mid2Q9QUS6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mid2Q9QUS6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mid2Q9QUS6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mid2Q9QUS6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms