Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms